干尼亚考古博物馆 (希腊语:-{Αρχαιολογικό Μουσείο Χανίων}-;英语:Archaeological Museum of Chania)是希腊克里特岛干尼亚的一个博物馆,1962年成立。
干尼亚考古博物馆设于原威尼斯人的圣方济各修道院,曾为该市最大的修道院,为方济各会修士住所,也是该市重要地标。
在奥斯曼帝国占领时期,修道院被改为清真寺,以征服干尼亚的Yussuf 帕夏命名。在20世纪该建筑曾改为电影院和仓库,1962年改为博物馆。
Archaeological Museum of Chania